Tým Stanfordovy univerzity a Arc Institute publikoval 6. srpna 2026 ve Science první doložený případ, kdy generativní AI navrhla kompletní funkční genom viru od nuly. Z asi tří set syntetizovaných návrhů jich šestnáct fungovalo v laboratoři a zabíjelo bakterie E. coli, včetně kmenů odolných vůči přirozenému bakteriofágu.
Vedli ji Brian Hie a doktorand Samuel King. Použili jazykové modely Evo 1 a Evo 2, dotrénované na necelých 14 300 genomech čeledi Microviridae, a jako šablonu jim zadali fág ΦX174, který napadá E. coli. Model z ní vygeneroval statisíce kandidátních genomů, k syntéze a laboratornímu testu nakonec vybrali kolem tří set.
Jak model “píše” virus
Evo funguje na stejném principu jako ChatGPT, jen místo písmen anglické abecedy pracuje se čtyřmi písmeny genetického kódu: A, C, G, T. Model natrénovaný na milionech přirozených genomů se naučí, která posloupnost písmen za jinou statisticky dává smysl, a umí pak generovat nové sekvence, které se drží stejné logiky. Architektura StripedHyena 2, na které Evo 2 stojí, zvládá zpracovat sekvence dlouhé až milion písmen najednou, takže dokáže “vidět” celý genom v kontextu, ne jen jeho útržky.
Proč zrovna bakteriofág? ΦX174 patří k nejmenším a nejlépe prostudovaným virům vůbec, má jen 11 genů a kolem 5 400 písmen DNA. Tým ho zvolil schválně jako zvládnutelný první test: než se pustit do složitějších organismů, potřebovali ověřit, jestli model dokáže navrhnout funkční genom vůbec. Trénovací sada navíc obsahovala výhradně fágy napadající bakterie, žádné viry schopné infikovat člověka, zvíře nebo rostlinu.
Z vygenerovaných návrhů prošlo počítačovým i experimentálním filtrováním kolem tří set, které tým nechal chemicky syntetizovat jako fyzické řetězce DNA a vpravil je do bakterií E. coli. Buňky pak podle vložené instrukce samy sestavily virové částice, bez dalšího lidského zásahu.
Fágy místo antibiotik
Šestnáct funkčních virů se lišilo od čehokoli, co existuje v přírodě: u jednoho z nich objevili pod kryoelektronovým mikroskopem balicí protein, který podle autorů studie evoluce nemohla vytvořit za miliony let. Koktejl ze všech šestnácti fágů dokázal zlikvidovat i bakterie, které si už vypěstovaly odolnost vůči přirozenému viru. Cílem výzkumu je terapie proti multirezistentním bakteriím, kde klasická antibiotika selhávají.
Bezpečnostní otázky
Studii ve Science doprovodil komentář biosecurity expertů z Johns Hopkins Center for Health Security. Thomas Inglesby a Moritz Hanke upozornili, že stejný postup by šlo v principu obrátit – Hanke to shrnul jednoduše: modelu prý stačí zadat, ať navrhne genom chřipky s vyšší nakažlivostí nebo smrtností. Trénovací data týmu záměrně vynechala viry napadající lidi, zvířata i rostliny, jenže systémy, které dnes kontrolují objednávky syntetické DNA, podle autorů komentáře nejsou na podobné sekvence vůbec připravené. Screening navíc v USA není ze zákona povinný.
Práce vyšla v otevřeném přístupu na science.org. Podle CNN (6. srpna 2026) autoři popisují výsledek jako první krok k navrhování složitějších genomů.
Terapie bakteriofágy by časem mohla léčit infekce, na které dnes lidé po celém světě umírají, hlavně tam, kde antibiotika už nezabírají. Otázka je, jak rychle se podobná léčba k pacientům vůbec dostane. Farmaceutické firmy dlouhodobě vydělávají spíš na dlouhodobém tlumení příznaků než na jednorázovém vyléčení, a levný fágový koktejl, který stačí nasadit jednou, se do tohohle byznys modelu nehodí. Kdo takový výzkum dotáhne až k reálnému pacientovi a za jakou cenu, zatím nikdo neví.
Zdroje
- King, S. et al. Generative design of bacteriophages with genome language models. Science, 6. 8. 2026. science.org/doi/10.1126/science.aec2657
- Inglesby, T., Hanke, M. Komentář k biosecurity rizikům. Science, 6. 8. 2026. science.org/doi/10.1126/science.aej8512
- CNN: AI creates 16 new viruses from scratch, showing promise for drug resistance and drawing warnings about potential for misuse, 6. 8. 2026. cnn.com/2026/08/06/health/ai-viruses-bacteriophages
- Tech Times: Stanford AI Wrote Viruses No Evolution Ever Produced; Biosecurity Gap Confirmed, 7. 8. 2026. techtimes.com/articles/323507